明洪武五年(1372年)今境大部为播州宣抚司，属四川行省，十五年(1382年)改属贵州都司，二十七年(1394年)复改属四川承公布政使司。今境东部为思南府和石阡府所辖，属贵州行省。
明万历二十八年（1600年）“平播之役”后，打消徒峋制度，实施“改土归流”，于次年分播州为遵义、平越两个“军民府”，别离附属四川、贵州两省。万历二十九年(1601年)改置遵义军民府，并徙治宣慰司西白田坝。
清康熙年间，播州宣抚司改称遵义府。今遵义市大部门区域属遵义府，附属四川省。东部部门区域属石阡府、思南府、平越州，附属贵州省。
清雍正五年（1727年），遵义府由四川省划归贵州省统领。雍正年间，云贵总督鄂尔泰提出贵州处事面积小经济气力弱，把黔北粮仓美誉的遵义、真安、绥阳、桐梓、怀仁，一府五州县划给了贵州，辅佐贵州的成长。而属于贵州的永宁县，由于离府城太远就与四川的叙永县归并。由于永宁有龙安营的驻防，以是永宁地域又称为龙安。贵州用一个县换了四川遵义一府四州县，四川感受是是吃了大亏，以是在黔北地域和叙永地域，民间就传播了这么一个顺口溜：四川人生得憨，遵义换龙安。
民国初年，清扫“府”的建制，今境附属黔中道。
民国24年（1935年），贵州省设11个行政督察区，黔北十余县为第五行政督察区。
1955年的遵义专区
1949年11月，遵义解放，“第五行政督察区”改为遵义专区，以原遵义县城区为基本新建遵义市 。专署驻遵义市，辖遵义市（由遵义县析置）及遵义（驻遵义市）、绥阳（驻洋川镇）、正安（驻凤仪镇）、道真（驻土溪场）、婺川（驻都濡镇）、凤冈（驻龙泉镇）、湄潭（驻义泉镇）、仁怀（驻中枢镇）、赤水、鳛水（驻东皇殿）、桐梓等11县。
1951年取消遵义市，并入遵义县。遵义专区辖11县。
1952年复设遵义市。辖1市、11县。
1955年遵义市改由省直辖。
1958年的遵义专区
1956年，镇远专区的余庆县划归遵义专区。
1956年，四川省綦江县2个村划归鳛水县。
1958年，遵义市降格为县级市，划归遵义专区，贵阳市息烽县划归遵义专区。取消遵义县，并入遵义市（县级），取消凤冈县并入湄潭县，取消道真县并入正安县。遵义专区专员公署驻遵义市，辖1市9县。
1976年的遵义地域
1959年，婺川县改名务川县；鳛水县改名为习水县。
1961年，规复遵义（驻南白镇）、道真（驻玉溪镇）、凤冈（驻龙泉镇）、余庆（驻白泥镇）4县。遵义专区辖1市、13县。
1963年，贵阳市开阳县划归遵义专区。
1965年，遵义专区息烽、开阳2县划归安顺专区，遵义专区辖1市、12县。
1970年。遵义专区改称遵义地域。
1990年的遵义地域
1986年撤务川、道真2县别离改设仡佬族苗族自治县。
1990年，取消赤水县，设县级赤水市，仍属遵义地域统领。
1999年的遵义市
1995年，取消仁怀县，设县级仁怀市，仍属遵义地域统领。
1997年，取消遵义地域，设地级遵义市。取消县级遵义市，设红花岗区。赤水市、仁怀市改为省辖市。地级遵义市共辖1区10县，市当局驻红花岗区。
1998年，赤水市、仁怀市改由遵义市代管。
2004年，设遵义市汇川区，辖红花岗区上海路以北城区和遵义县北区部门州里。遵义市辖2区2市10县。
2013年7月1日，仁怀市举办省直管县试点。
2016年3月，取消遵义市遵义县，设遵义市播州区。以原遵义县（不含山盆镇、芝麻镇、沙湾镇、毛石镇、松林镇、新舟镇、虾子镇、三渡镇、永乐镇、喇叭镇）的行政地区为播州区的行政地区。将原遵义县的山盆镇、芝麻镇、沙湾镇、毛石镇、松林镇划归遵义市汇川区统领。将原遵义县的新舟镇、虾子镇、三渡镇、永乐镇、喇叭镇和遵义市汇川区的北京路街道划归遵义市红花岗区统领。
2019年7月1日起，仁怀市由省直管调解为由遵义市打点。
制止2021年，遵义市下辖3个区、7个县、2个民族自治县、代管2个县级市。即：红花岗区、汇川区、播州区、桐梓县、绥阳县、正安县、道真仡佬族苗族自治县、务川仡佬族苗族自治县、凤冈县、湄潭县、余庆县、习水县、仁怀市、赤水市。
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